Les historiens ne se sont pas mis d’accord sur l’origine de l’appellation ‘Ben Guerdane’. En effet, certains historiens pensent que l’origine de Ben Guerdane reviendrait au mot français ‘gardien’, le gardien qui surveillait le fort qui gardait les provisions des tribus, ou encore du oiseau ‘Héron garde-bœufs’ à cause des quantités d’eau qui se trouvaient à cet endroit.
Cependant, quelques historiens remettent en cause l’origine française de l’appellation ‘Ben Guerdane’, étant donné que le fort existait bien avant l’apparition de la colonisation française. Ces mêmes historiens tendent à croire que l’origine de cette appellation serait amazighe, et serait reliée à un mot égyptien qui signifie les colliers.
La théorie de l’origine amazighe est appuyée par les différents mots d’origine amazighe qui sont utilisés dans la région de Ben Guerdane.